Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kdm4aQ8BW72 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4aQ8BW72 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4aQ8BW72 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms