Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp38Q8BW70 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp38Q8BW70 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp38Q8BW70 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms