Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Triml1Q8BVP1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Triml1Q8BVP1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms