Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pggt1bQ8BUY9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pggt1bQ8BUY9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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