Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup54Q8BTS4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nup54Q8BTS4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nup54Q8BTS4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms