Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep55Q8BT07 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep55Q8BT07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms