Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gga3Q8BMI3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gga3Q8BMI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms