Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hirip3Q8BLH7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hirip3Q8BLH7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms