Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D130040H23RikQ8BII3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
D130040H23RikQ8BII3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
D130040H23RikQ8BII3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms