Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhe23Q8BGW3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhe23Q8BGW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms