Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U2af1l4Q8BGJ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2af1l4Q8BGJ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms