Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htatsf1Q8BGC0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Htatsf1Q8BGC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Htatsf1Q8BGC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms