Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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