Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Katnb1Q8BG40 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms