Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdspl2Q8BG15 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdspl2Q8BG15 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdspl2Q8BG15 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdspl2Q8BG15 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctdspl2Q8BG15 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctdspl2Q8BG15 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctdspl2Q8BG15 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms