Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M10.3Q85ZW6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M10.3Q85ZW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.3Q85ZW6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms