Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atg4cQ811C2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms