Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc50Q810U5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms