Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2bQ80ZJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cracr2bQ80ZJ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms