Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc1Q80VQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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