Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep170bQ80U49 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cep170bQ80U49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms