Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdc42bpbQ7TT50 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms