Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q1Q7TSS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms