Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ClmQ7TSN2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms