Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tnfsf18Q7TS55 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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