Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc93Q7TQK5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc93Q7TQK5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc93Q7TQK5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms