Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp397Q7TNK4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zfp397Q7TNK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp397Q7TNK4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms