Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nphp3Q7TNH6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nphp3Q7TNH6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms