Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sbno2Q7TNB8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sbno2Q7TNB8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno2Q7TNB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms