Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp1r3cQ7TMB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp1r3cQ7TMB3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms