Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ScocQ78YZ6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201 ms