Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TwistnbQ78WZ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TwistnbQ78WZ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms