Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vma21Q78T54 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vma21Q78T54 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms