Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssh1Q76I79 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ssh1Q76I79 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssh1Q76I79 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms