Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sned1Q70E20 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sned1Q70E20 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms