Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl35Q6ZWV7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms