Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl9Q6ZPT1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl9Q6ZPT1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms