Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Glis3Q6XP49 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Glis3Q6XP49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Glis3Q6XP49 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms