Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Rhox8Q6VSS7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Rhox8Q6VSS7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rhox8Q6VSS7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms