Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casc1Q6TDU8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc1Q6TDU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms