Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shc4Q6S5L9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms