Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGL7

Washc2, WASH complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc2Q6PGL7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Washc2Q6PGL7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Washc2Q6PGL7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Washc2Q6PGL7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms