Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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