Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vstm2lQ6PDS0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vstm2lQ6PDS0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms