Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dtx4Q6PDK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dtx4Q6PDK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms