Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smarcc2Q6PDG5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcc2Q6PDG5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms