Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rundc3bQ6PDC0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc3bQ6PDC0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms