Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhb9Q6PB60 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhb9Q6PB60 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms