Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Slf2Q6P9P0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms