Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sik3Q6P4S6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sik3Q6P4S6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sik3Q6P4S6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms